大拇指指甲不平有凹凸可能是营养缺乏、炎症感染、过敏反应等问题所引起，具体的分析如下：
1、营养缺乏：大拇指指甲凹凸不平有可能是营养物质缺乏的原因所引起，特别是缺乏B族维生素或者维生素C，遵照医生嘱托做血常规、微量元素检查等，如果有缺乏的情况及时的补充。
2、炎症感染：指甲部位的肌肤受到细菌真菌病毒感染后，有可能会引起甲沟炎，使局部指甲出现凹凸不平、脆弱等情况。在医生指导下通过涂抹或者口服抗炎药物治疗，如红霉素软膏、左氧氟沙星片、阿莫西林胶囊等。
3、过敏反应：指甲长时间接触一些过敏物质后，会导致指甲的生长受到影响，有可能会出现凹凸不平的表现症状，遵照医生嘱托涂抹抗过敏的药膏治疗，如复方曲安奈德乳膏、糠酸莫米松乳膏、他克莫司软膏等。