菌屋不需要清洗。将菌房放入水中，作为培养硝化菌的滤材。清洗会导致大量硝化细菌死亡，对整体生态环境非常不利。由于菌房是用来培养细菌的，所以不需要经常更换，一般半年到一年，每次只更换总量的一半。新的菌房要用清水冲洗干净，在沸水中浸泡20分钟，然后放入水中。
玻璃环也叫生物环或细菌屋，是最经济高效的滤材，一般由滑石粉烧制而成，多孔，表面积大，适合大量硝化菌居住。
过滤石英陶瓷环采用天然硅酸盐原料经1200℃高温烧结而成，化学性能稳定，完全符合微生物原始生活的化学环境，独具的多孔隙结构，单位表面积是一般生化环的6-9倍，高渗透性，可同时进行好氧性硝化作用及厌氧化脱氮作用，使水质更加稳定，是最佳的生物过滤材料。